零番隊在《死神》中是一個強大的組織，而最終被全滅的原因里面，又有很多不同的因素。其中最為重要的原因就是零番隊的領導結構存在著漏洞，并且與外界的聯系脆弱，這使得組織內部不可避免地出現了，最終導致了組織的全部滅亡。

首先，零番隊內部的派系斗爭是導致組織失敗的重要原因之一。在零番隊的頂層領導核心中，存在著幾個不同的派系，每一個派系都有著不同的目標和利益。然而，不同的派系彼此之間存在著相互矛盾的情況，這就導致了內部的爭斗不斷。由于零番隊是整個滅卻師聯盟內最為強大的組織，因此派系內部的爭斗也就更加激烈，最終導致了組織在內部自行解體。

其次，零番隊無法與外部保持良好的交流和溝通。由于零番隊高層人員太過隱秘，他們對外界保持著相對封閉的態度，幾乎不與外部的人員進行交流。這就導致了外部的一些問題無法被及時發現和解決，而最終演變成更大的問題。這種情況使得零番隊在編隊和行動的時候無法有效地整合外部的資源和力量，而這就成了組織滅亡的必然結果。

另外一個導致零番隊全滅的原因是，他們的核心成員，并沒有真正理解自己的使命和責任。在初期，零番隊是一支有著強大使命感和榮譽感的組織，他們的目標就是要將隱匿界和人間界兩個世界之間的聯系完全切斷。但是隨著時間的推移和組織整體的壯大，組織內部逐漸出現了“利益第一”的思想，其中一些成員逐漸喪失了為人民和世界而戰的初衷。這就導致了組織的核心價值觀和使命感逐漸被丟棄，最終導致組織的和崩潰。

綜上所述，零番隊在滅亡過程中存在著極為重要的因素，其中內部派系斗爭、外部聯系脆弱以及成員的意識改變都成為了導致組織滅亡的原因。從這一點來看，這也許是零番隊的悲劇之一，未能保持住“為人民服務”的初衷，最終被戰敗打回原形。